Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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H2-M1F7CXU4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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H2-M1F7CXU4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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H2-M1F7CXU4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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H2-M1F7CXU4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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H2-M1F7CXU4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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H2-M1F7CXU4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-M1F7CXU4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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