Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
D430041D05RikF6ZGR6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
D430041D05RikF6ZGR6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D430041D05RikF6ZGR6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
D430041D05RikF6ZGR6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
D430041D05RikF6ZGR6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms