Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cald1E9QA15 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cald1E9QA15 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms