Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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