Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pdzd7E9Q9W7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms