Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rdh16f1E9Q9P8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rdh16f1E9Q9P8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms