Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp31E9Q6Y8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp31E9Q6Y8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp31E9Q6Y8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms