Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DspE9Q557 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
DspE9Q557 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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