Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trip11E9Q512 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trip11E9Q512 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms