Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CenpfE9Q3P4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms