Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2010300C02RikE9Q3M9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2010300C02RikE9Q3M9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms