Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms