Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r238E9Q373 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms