Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430401F13RikE9Q328 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430401F13RikE9Q328 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms