Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdzd2E9Q1M1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pdzd2E9Q1M1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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