Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms