Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fndc1E9Q043 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fndc1E9Q043 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms