Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gcom1E9PZ54 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gcom1E9PZ54 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms