Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3298E9PW80 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm3298E9PW80 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3298E9PW80 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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