Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde2E9PUP1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Syde2E9PUP1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms