Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ38

Gm45062, Predicted gene 45062, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45062E0CZ38 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm45062E0CZ38 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm45062E0CZ38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms