Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc6D3YZP9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc6D3YZP9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms