Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm42791D3YYB5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms