Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SafbD3YXK2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SafbD3YXK2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms