Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2d4D3YUH6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms