Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gm17333C6EQI3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm17333C6EQI3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm17333C6EQI3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm17333C6EQI3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm17333C6EQI3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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