Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Phf11bB4XVQ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Phf11bB4XVQ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Phf11bB4XVQ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Phf11bB4XVQ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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