Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pnldc1B2RXZ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pnldc1B2RXZ1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms