Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr3aB2RXC6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Polr3aB2RXC6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr3aB2RXC6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Polr3aB2RXC6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms