Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Siah3B2RWG3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Siah3B2RWG3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms