Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prrt4B2RU40 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrt4B2RU40 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms