Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Zscan5bB2RTN3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms