Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol7aB2RT54 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms