Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdc2B2RR83 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdc2B2RR83 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms