Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34b1B1AZQ8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b1B1AZQ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms