Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox1B1APN4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox1B1APN4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox1B1APN4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox1B1APN4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox1B1APN4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhox1B1APN4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhox1B1APN4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms