Protein–RNA interactions for Protein: A6PWV5

Arid3c, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3cA6PWV5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arid3cA6PWV5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Arid3cA6PWV5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms