Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ttll11A4Q9F4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ttll11A4Q9F4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms