Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttll2A4Q9E4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms