Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Plcb2A3KGF7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Plcb2A3KGF7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms