Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scn3aA2ASI5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scn3aA2ASI5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms