Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttll9A2APC3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms