Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprfA2A8L5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprfA2A8L5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms