Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pkd2l1A2A259 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkd2l1A2A259 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms