Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Nphp1Q9QY53 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0,72□□□□□ -2,52
Nphp1Q9QY53 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC-0,73□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm22196-201ENSMUST00000116865 109 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0,74□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm45688-201ENSMUST00000210002 101 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC-0,75□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC-0,76□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC-0,77□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC-0,77□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0,77□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0,77□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0,77□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC-0,78□□□□□ -2,53
Nphp1Q9QY53 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm23507-201ENSMUST00000083078 107 ntBASIC-0,79□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC-0,8□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0,81□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm27735-201ENSMUST00000185085 76 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC-0,82□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC-0,83□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Mir18b-201ENSMUST00000103923 83 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm27884-201ENSMUST00000183865 76 ntBASIC-0,84□□□□□ -2,54
Nphp1Q9QY53 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC-0,85□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC-0,85□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC-0,85□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC-0,85□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0,86□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-0,87□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-0,87□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC-0,87□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 AC167019.1-201ENSMUST00000227913 106 ntBASIC-0,87□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC-0,87□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC-0,88□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC-0,88□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC-0,88□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC-0,88□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC-0,88□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC-0,89□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC-0,89□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-0,89□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC-0,89□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm22813-202ENSMUST00000200346 124 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC-0,9□□□□□ -2,55
Nphp1Q9QY53 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Gm44311-201ENSMUST00000196448 69 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0,91□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-0,92□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC-0,92□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0,93□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Gm26233-201ENSMUST00000175530 70 ntBASIC-0,93□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-0,93□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Gm24714-201ENSMUST00000102382 101 ntBASIC-0,95□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 Mir5124b-201ENSMUST00000184251 85 ntBASIC-0,95□□□□□ -2,56
Nphp1Q9QY53 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC-0,95□□□□□ -2,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122,4 ms