Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1,81□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC1,81□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1,81□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1,81□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1,8□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC1,8□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1,8□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1,8□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm27937-201ENSMUST00000183605 88 ntBASIC1,8□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1,8□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC1,8□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1,8□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm23347-201ENSMUST00000083823 82 ntBASIC1,79□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,79□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1,78□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC1,78□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1,78□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC1,78□□□□□ -2,12
SrfQ9JM73 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC1,77□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC1,77□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1,77□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC1,77□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1,77□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1,76□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1,76□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1,75□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC1,75□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,75□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm22459-201ENSMUST00000082577 108 ntBASIC1,74□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,74□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm25440-201ENSMUST00000158279 154 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm22474-201ENSMUST00000179407 107 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1,73□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,72□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1,72□□□□□ -2,13
SrfQ9JM73 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,71□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1,71□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm11084-201ENSMUST00000112062 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,7□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1,7□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm25010-201ENSMUST00000158403 65 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1,69□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1,69□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,69□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,68□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1,68□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm24996-201ENSMUST00000158390 99 ntBASIC1,68□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1,68□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm26375-201ENSMUST00000101829 106 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1,67□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1,66□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Mir669a-3-201ENSMUST00000102074 109 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm24400-201ENSMUST00000157865 107 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Mir7231-201ENSMUST00000196252 61 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm24259-201ENSMUST00000083740 107 ntBASIC1,66□□□□□ -2,14
SrfQ9JM73 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
SrfQ9JM73 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
SrfQ9JM73 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
SrfQ9JM73 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1,65□□□□□ -2,15
SrfQ9JM73 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
SrfQ9JM73 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
SrfQ9JM73 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1,64□□□□□ -2,15
SrfQ9JM73 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC1,64□□□□□ -2,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114,2 ms