Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Rabgef1Q9JM13 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Rabgef1Q9JM13 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Rabgef1Q9JM13 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Rabgef1Q9JM13 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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