Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8
Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Ubxn4 | Q8VCH8 | AC113441.1-201 | ENSMUST00000223464 | 134 nt | BASIC | 0,95 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25894-201 | ENSMUST00000083458 | 75 nt | BASIC | 0,95 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir27b-201 | ENSMUST00000083541 | 73 nt | BASIC | 0,95 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | AC124196.2-201 | ENSMUST00000224835 | 145 nt | BASIC | 0,94 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23708-201 | ENSMUST00000104367 | 123 nt | BASIC | 0,93 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23790-201 | ENSMUST00000083013 | 107 nt | BASIC | 0,93 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22100-201 | ENSMUST00000157926 | 63 nt | BASIC | 0,92 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm44455-201 | ENSMUST00000200061 | 82 nt | BASIC | 0,92 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir10b-201 | ENSMUST00000083566 | 68 nt | BASIC | 0,92 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22140-201 | ENSMUST00000158745 | 120 nt | BASIC | 0,91 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25366-201 | ENSMUST00000158845 | 124 nt | BASIC | 0,91 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25449-201 | ENSMUST00000179389 | 79 nt | BASIC | 0,91 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm27686-201 | ENSMUST00000185123 | 91 nt | BASIC | 0,91 | □□□□□ -2,26 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Traj13-201 | ENSMUST00000103728 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | 0,9 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mirlet7g-201 | ENSMUST00000083506 | 88 nt | BASIC | 0,9 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25496-201 | ENSMUST00000104430 | 120 nt | BASIC | 0,89 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Snord2-201 | ENSMUST00000157899 | 69 nt | BASIC | 0,88 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24202-201 | ENSMUST00000082948 | 103 nt | BASIC | 0,88 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24697-201 | ENSMUST00000083881 | 107 nt | BASIC | 0,88 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm3702-201 | ENSMUST00000211754 | 346 nt | BASIC | 0,87 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23735-201 | ENSMUST00000082551 | 134 nt | BASIC | 0,87 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23349-201 | ENSMUST00000158432 | 98 nt | BASIC | 0,86 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir6389-201 | ENSMUST00000183661 | 102 nt | BASIC | 0,86 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | AC154506.4-201 | ENSMUST00000224898 | 3416 nt | BASIC | 0,86 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir7229-201 | ENSMUST00000197062 | 53 nt | BASIC | 0,85 | □□□□□ -2,27 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23012-201 | ENSMUST00000104149 | 83 nt | BASIC | 0,83 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22522-201 | ENSMUST00000158271 | 151 nt | BASIC | 0,83 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm20386-201 | ENSMUST00000174010 | 132 nt | BASIC | 0,83 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Olfr867-203 | ENSMUST00000216538 | 4617 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 0,83 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24384-201 | ENSMUST00000122693 | 75 nt | BASIC | 0,82 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm8251-201 | ENSMUST00000168641 | 5985 nt | APPRIS P1 BASIC | 0,81 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24278-201 | ENSMUST00000104239 | 127 nt | BASIC | 0,81 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm29047-201 | ENSMUST00000189816 | 108 nt | BASIC | 0,81 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm20108-201 | ENSMUST00000219977 | 153 nt | BASIC | 0,81 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22303-201 | ENSMUST00000082686 | 122 nt | BASIC | 0,81 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26484-201 | ENSMUST00000158018 | 106 nt | BASIC | 0,8 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23008-201 | ENSMUST00000158946 | 80 nt | BASIC | 0,8 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26425-201 | ENSMUST00000122529 | 82 nt | BASIC | 0,79 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22429-201 | ENSMUST00000158553 | 130 nt | BASIC | 0,79 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir3105-201 | ENSMUST00000175480 | 85 nt | BASIC | 0,79 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm44457-201 | ENSMUST00000198109 | 76 nt | BASIC | 0,79 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir5117-201 | ENSMUST00000083226 | 84 nt | BASIC | 0,79 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23347-201 | ENSMUST00000083823 | 82 nt | BASIC | 0,79 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23369-201 | ENSMUST00000175406 | 105 nt | BASIC | 0,78 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm38113-201 | ENSMUST00000193704 | 201 nt | BASIC | 0,78 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24920-201 | ENSMUST00000083018 | 85 nt | BASIC | 0,78 | □□□□□ -2,28 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24579-201 | ENSMUST00000103964 | 144 nt | BASIC | 0,77 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | AC122327.1-201 | ENSMUST00000220778 | 108 nt | BASIC | 0,77 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22406-201 | ENSMUST00000174923 | 93 nt | BASIC | 0,76 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24983-201 | ENSMUST00000104457 | 69 nt | BASIC | 0,75 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir3109-201 | ENSMUST00000175301 | 88 nt | BASIC | 0,75 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25229-201 | ENSMUST00000178587 | 79 nt | BASIC | 0,75 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm44327-201 | ENSMUST00000200068 | 117 nt | BASIC | 0,75 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22251-201 | ENSMUST00000083216 | 107 nt | BASIC | 0,75 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir3473d-201 | ENSMUST00000175346 | 81 nt | BASIC | 0,74 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm27639-201 | ENSMUST00000184937 | 85 nt | BASIC | 0,74 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24963-201 | ENSMUST00000157916 | 144 nt | BASIC | 0,73 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22732-201 | ENSMUST00000158093 | 121 nt | BASIC | 0,73 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Snord95-201 | ENSMUST00000082846 | 68 nt | BASIC | 0,73 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22729-201 | ENSMUST00000158088 | 129 nt | BASIC | 0,72 | □□□□□ -2,29 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24323-201 | ENSMUST00000175342 | 77 nt | BASIC | 0,71 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22677-201 | ENSMUST00000116977 | 108 nt | BASIC | 0,7 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22205-201 | ENSMUST00000122655 | 71 nt | BASIC | 0,7 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25622-201 | ENSMUST00000157217 | 104 nt | BASIC | 0,7 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm27980-201 | ENSMUST00000184094 | 169 nt | BASIC | 0,7 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm45541-201 | ENSMUST00000210443 | 54 nt | BASIC | 0,7 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25787-201 | ENSMUST00000104709 | 92 nt | BASIC | 0,69 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22605-201 | ENSMUST00000158289 | 108 nt | BASIC | 0,69 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm24637-201 | ENSMUST00000158674 | 85 nt | BASIC | 0,69 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir216a-201 | ENSMUST00000083605 | 72 nt | BASIC | 0,69 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23500-201 | ENSMUST00000157735 | 98 nt | BASIC | 0,68 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22203-201 | ENSMUST00000158605 | 58 nt | BASIC | 0,68 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25160-201 | ENSMUST00000158914 | 102 nt | BASIC | 0,68 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26441-201 | ENSMUST00000082590 | 104 nt | BASIC | 0,68 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23038-201 | ENSMUST00000083873 | 104 nt | BASIC | 0,68 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22354-201 | ENSMUST00000083919 | 70 nt | BASIC | 0,68 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Olfr1099-202 | ENSMUST00000213456 | 4867 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 0,68 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm13577-201 | ENSMUST00000121365 | 205 nt | BASIC | 0,67 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22239-201 | ENSMUST00000175220 | 103 nt | BASIC | 0,67 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir670-201 | ENSMUST00000102380 | 100 nt | BASIC | 0,66 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23126-201 | ENSMUST00000104260 | 134 nt | BASIC | 0,66 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23528-201 | ENSMUST00000104571 | 132 nt | BASIC | 0,66 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm42845-201 | ENSMUST00000197766 | 105 nt | BASIC | 0,66 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25696-201 | ENSMUST00000082900 | 105 nt | BASIC | 0,66 | □□□□□ -2,3 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25408-201 | ENSMUST00000104104 | 133 nt | BASIC | 0,64 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir7079-201 | ENSMUST00000184697 | 69 nt | BASIC | 0,64 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25756-201 | ENSMUST00000103990 | 136 nt | BASIC | 0,63 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir7065-201 | ENSMUST00000185110 | 61 nt | BASIC | 0,63 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | CT009723.2-201 | ENSMUST00000215702 | 124 nt | TSL 5 BASIC | 0,63 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23321-201 | ENSMUST00000104465 | 126 nt | BASIC | 0,62 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm23783-201 | ENSMUST00000157941 | 102 nt | BASIC | 0,62 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25656-201 | ENSMUST00000158466 | 66 nt | BASIC | 0,62 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm26236-201 | ENSMUST00000175536 | 137 nt | BASIC | 0,62 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm25022-201 | ENSMUST00000102205 | 83 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Gm22983-201 | ENSMUST00000158308 | 104 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir467a-6-201 | ENSMUST00000177790 | 83 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir467a-3-201 | ENSMUST00000178082 | 83 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir467a-7-201 | ENSMUST00000178635 | 83 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir467a-10-201 | ENSMUST00000179320 | 83 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Ubxn4 | Q8VCH8 | Mir467a-5-201 | ENSMUST00000179352 | 83 nt | BASIC | 0,61 | □□□□□ -2,31 | | |
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104,6 ms