Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm24129-201ENSMUST00000158537 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm26202-201ENSMUST00000082910 65 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm25870-201ENSMUST00000179845 79 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Uhrf2Q7TMI3 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm24983-201ENSMUST00000104457 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm5581-201ENSMUST00000072940 2550 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm25366-201ENSMUST00000158845 124 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm24226-201ENSMUST00000158826 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms