Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 AC161271.1-201ENSMUST00000226914 150 ntBASIC-2,03□□□□□ -2,73
NipblQ6KCD5 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC-2,03□□□□□ -2,73
NipblQ6KCD5 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC-2,03□□□□□ -2,73
NipblQ6KCD5 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC-2,03□□□□□ -2,73
NipblQ6KCD5 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC-2,03□□□□□ -2,73
NipblQ6KCD5 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC-2,03□□□□□ -2,73
NipblQ6KCD5 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Mir295-201ENSMUST00000104694 69 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm25143-201ENSMUST00000082696 109 ntBASIC-2,04□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm27882-201ENSMUST00000184904 74 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC-2,05□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC-2,06□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC-2,07□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC-2,08□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm10663-201ENSMUST00000098716 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2,08□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC-2,09□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-2,1□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,74
NipblQ6KCD5 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm26008-201ENSMUST00000158797 99 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC-2,1□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC-2,11□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm25867-201ENSMUST00000158254 103 ntBASIC-2,11□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm25087-201ENSMUST00000101992 78 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm26467-201ENSMUST00000097257 78 ntBASIC-2,12□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm22717-201ENSMUST00000122703 171 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2,13□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC-2,13□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm23590-201ENSMUST00000157661 104 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm25367-201ENSMUST00000158846 106 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Mir181b-1-201ENSMUST00000083524 80 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC-2,14□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2,15□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC-2,15□□□□□ -2,75
NipblQ6KCD5 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
NipblQ6KCD5 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
NipblQ6KCD5 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
NipblQ6KCD5 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
NipblQ6KCD5 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
NipblQ6KCD5 Gm25646-201ENSMUST00000178527 79 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
NipblQ6KCD5 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC-2,16□□□□□ -2,76
NipblQ6KCD5 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-2,17□□□□□ -2,76
NipblQ6KCD5 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
NipblQ6KCD5 Gm23210-201ENSMUST00000158668 98 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
NipblQ6KCD5 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC-2,17□□□□□ -2,76
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